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沖縄総合事務局(おきなわそうごうじむきょく)は、沖縄県の本土復帰と同時に、復興開発を効率的に進めるために作られた国の出先機関である。2001年(平成13年)1月6日の省庁再編により、内閣府の地方支分部局として再編された。

2008年(平成20年)3月24日に、那覇市おもろまち二丁目の那覇第2地方合同庁舎2号館へ庁舎を新築・移転した。

◆ 主な役割

・沖縄県の復興計画の作成および推進

・沖縄県の経済・社会の開発

・公正取引委員会事務総局の事務所としての役割

・財務省の財務局としての役割(財務部所管)

・農林水産省の地方農政局・民有林監督・水産庁の一部の役割(農林水産部所管)

・経済産業省の経済産業局としての役割(経済産業部所管)

・国土交通省の地方整備局としての役割(開発建設部所管)

・国土交通省の地方運輸局としての役割(運輸部所管)

参考までに、以下に各省庁の地方出先機関(施設等機関、地方支分部局など)として独自に設けられているものを挙げる。(部局名)内は上位組織に相当する支分部局。

:(福岡法務局)

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|福岡入国管理局那覇支局||本省入国管理局(福岡入国管理局)

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|那覇保護観察所||本省保護局

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|那覇公安調査事務所||公安調査庁(九州公安調査局)

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|外務省||外務省沖縄事務所

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|rowspan="2"|財務省||沖縄地区税関||本省関税局

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|沖縄国税事務所||国税庁

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|rowspan="6"|厚生労働省||那覇検疫所||本省健康局

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|九州厚生局沖縄分室||(九州厚生局)

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|九州厚生局沖縄麻薬取締支所||(九州厚生局)

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|沖縄労働局||本省労働関係部局

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|沖縄社会保険事務局||社会保険庁

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|中央労働委員会事務局九州地方事務所沖縄分室||中央労働委員会

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|rowspan="3"|農林水産省||那覇植物防疫事務所||本省消費・安全局植物防疫課

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|動物検疫所沖縄支所||本省消費・安全局国際衛生対策室

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|九州森林管理局沖縄森林管理署||林野庁

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|経済産業省||那覇産業保安監督事務所||資源エネルギー庁

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|rowspan="5"|国土交通省||大阪航空局那覇空港事務所||本省航空局

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|沖縄気象台||気象庁

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|第十一管区海上保安本部||海上保安庁

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|門司地方海難審判所那覇支部||海難審判所

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|環境省||九州地方環境事務所那覇自然環境事務所

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|防衛省||沖縄防衛局||

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◆ 沿革

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